E’ stato Nicky Hayden con la Honda, con il tempo di 1’59″773, il più veloce nella prima giornata di prove libere sul circuito di Motegi. Sull’asfalto bagnato il pilota statunitense ha preceduto di 119 millesimi la Yamaha di Valentino Ross e di quasi un secondo Casey Stoner sulla Ducati.
Quarto posto per Jorge Lorenzo, in sella all’altra Yamaha, male invece gli altri italiani: Dovizioso nono, Melandri 14esimo e Capirossi, vincitore delle ultime 3 edizioni, 16esimo.